新抗生素药物的第二次机会

越来越多的细菌对许多常用抗生素产生了耐药性。波鸿的研究人员发现了一种潜在活性分子的新机会，该分子的前身被拒绝了。通过在三个维度上非常精确地研究其与细菌靶蛋白的相互作用，他们确定了该化合物可以对的先前未检测到的攻击点。

化学与生物化学学院生物分子核磁共振波谱研究小组负责人 Raphael Stoll 教授解释说：“由于这一攻击点仅发生在细菌蛋白质中，因此该药物将变得更具选择性，并且对人体细胞的危害也会减少。”德国波鸿鲁尔大学。

20年前的重大尝试

该研究的重点是蛋白质肽去甲酰化酶(PDF)。 PDF 参与细胞中蛋白质的成熟过程，对于细菌的生存至关重要。然而，它在细菌和人体细胞中都存在。 “大约 20 年前，人们尝试用抗生素来对抗 PDF，”Stoll 指出。

“然而，最初的候选药物放线菌素由于多种原因而不得不被丢弃。面临的问题之一是新发现的人类 PDF，它可能与副作用有关。尽管如此，仍进行了进一步的研究以生成修饰的活性化合物”，亨德里克·科施纳补充道。

作为博士论文的一部分，他在当前的研究中详细研究了 PDF，并利用生物分子核磁共振 (NMR) 光谱和 X 射线晶体学从结构生物学的角度对其进行了分析。这些技术使他能够获得解析最小细节的 3D 结构。

“这是我们与同事埃克哈德霍夫曼教授多年合作的结果，”斯托尔说。

活性分子经过调整并变得更具选择性

“我们可以使用这些技术来可视化生物分子的表面和结合袋，并表明分子与这种蛋白质的结合不是静态的，而是动态的，”Kirschner 解释道。

研究人员注意到，修饰药物分子的蛋白质中有两种不同的结合方向：除了人类 PDF 中也存在的方向外，原则上还有另一种方向只出现在细菌 PDF 中。

“这促使我们修改药物分子，使其有利于第二个结合方向，”斯托尔说。

结果，抗生素分子可以变得更具选择性。 “它可以为该候选药物提供第二次机会，”科什纳总结道。